Es gibt doch Encoding-Programme. Am besten nutzt du direkt ffmpeg. Wenn dus etwas einfacher haben willst, nimm Super 2009. Das ist ein Interface für ffmpeg, mencoder und noch zwei drei andere Dinge. Das limitiert dich zwar ein wenig in einigen Einstellungen, aber letztlich solltest du damit die gewünschten Ergebnisse erzielen.

MfG